Τα Κύθηρα διαθέτουν μεγάλη ποικιλία στα είδη βλάστησης που ευδοκιμούν στο νησί. Στα πεδινά επικρατούν τα ελαιόδεντρα, στα προστατευμένα από τους ανέμους λαγκάδια συχνότερα είναι τα οπωροφόρα, ενώ γενικά επικρατεί η χαμηλή θαμνώδης βλάστηση. Από τα πιο διαδεδομένα είδη είναι το θυμάρι, που προσδίδει την ιδιαιτερότητα του αρώματός του στο τοπικό μέλι. Στα Κύθηρα έχουν καταγραφεί πάνω από 700 είδη φυτών. Μεταξύ αυτών πολλά μοναδικά είδη λουλουδιών και βοτάνων. Σήμα κατατεθέν του νησιού, η Σεμπρεβίβα (sempre viva=πάντα ζωντανή), το μικρό αμάραντο κίτρινο λουλούδι. Απαράμιλλης ομορφιάς είναι επίσης οι άγριες κόκκινες τουλίπες, με την τοπική ονομασία «Καστανιόλες», τα κρινάκια της Παναγίας, τα μυρωδάτα μανούσια καθώς και οι υπέροχες σπάνιες ορχιδέες.

Η πανίδα του νησιού είναι εξίσου ήπια και αντιπροσωπεύεται από μικρά συμπαθητικά άγρια ζώα, ενώ εκλείπουν εντελώς δηλητηριώδη είδη. Μεγάλη παρουσία έχουν οι λαγοί και ένα είδος μικρής αλεπούς που οι ντόπιοι αποκαλούν «Ζουρίδα». Συγχρόνως δεκάδες είδη μεταναστευτικών πουλιών σταματούν στα Κύθηρα την Άνοιξη και το Φθινόπωρο.