Cythère dispose d’une grande diversité d’espèces végétales, auxquelles les conditions de l’île sont favorables. Les oliveraies prédominent dans les plaines, les arbres fruitiers sont fréquents plutôt dans les vallons protégées des vents, tandis que les broussailles et la végétation basse prédominent en général. Parmi les espèces les plus répandues ici, il convient de remarquer le thym qui apporte la particularité de sa fragrance au miel local. Plus de 700 espèces de plantes ont été répertoriées à Cythère, notamment beaucoup de fleurs et d’herbes uniques. Le signe distinctif de l’île, c’est l’immortelle, la petite fleur jaune inflétrissable, connue dans le passé sous le nom de Sempreviva (de « sempre viva » = « toujours vivante »). La beauté extraordinaire est aussi la raison de mentionner les tulipes sauvages rouges que l’on appelle ici «Kastanioles», les lis de mer de la Sainte Vierge, les violettes odorantes et les orchidées sublimes et très rares.

La faune de l’île est aussi représentée par de petites espèces d’animaux sauvages sympathiques, tandis que les espèces vénéneuses sont complètement absentes. En grande quantité, on rencontre les lièvres et une espèce de petit renard que les habitants locaux appellent «zouride». En plus, de dizaines espèces d’oiseaux migrateurs font une escale à Cythère au printemps et en automne.